Сотрудники ФГБУ «НМИЦ ТПМ» Минздрава России получили патент на изобретение № 2762958 «Способ прогнозирования риска развития ишемической болезни сердца на основании данных генетического тестирования»

Федеральной службой по интеллектуальной собственности коллективу Авторов в составе:

• Мешков Алексей Николаевич, руководитель Лаборатории молекулярной генетики ФГБУ «НМИЦ ТПМ» Минздрава России, кандидат медицинских наук
• Киселева Анна Витальевна, старший научный сотрудник Лаборатории молекулярной генетики ФГБУ «НМИЦ ТПМ» Минздрава России, кандидат биологических наук
• Ершова Александра Игоревна, руководитель Лаборатории клиномики ФГБУ «НМИЦ ТПМ» Минздрава России, кандидат медицинских наук
• Жарикова Анастасия Александровна, научный сотрудник Лаборатории молекулярной генетики ФГБУ «НМИЦ ТПМ» Минздрава России
• Раменский Василий Евгеньевич, руководитель Лаборатории геномной и медицинской биоинформатики ФГБУ «НМИЦ ТПМ» Минздрава России, кандидат физико-математических наук
• Сотникова Евгения Андреевна, младший научный сотрудник Лаборатории молекулярной генетики ФГБУ «НМИЦ ТПМ» Минздрава России
• Вяткин Юрий Викторович, программист Лаборатории геномной и медицинской биоинформатики ФГБУ «НМИЦ ТПМ» Минздрава России
• Драпкина Оксана Михайловна, директор ФГБУ «НМИЦ ТПМ» Минздрава России, член-корреспондент РАН, профессор, доктор медицинских наук

был выдан патент на изобретение № 2762958 «Способ прогнозирования риска развития ишемической болезни сердца на основании данных генетического тестирования».

Изобретение относится к области медицины, а именно кардиологии, и может быть использовано для определения риска развития ишемической болезни сердца (ИБС) на основании данных генетического теста. Изобретение позволяет выявлять лиц с повышенным риском развития ИБС при проведении превентивного генетического тестирования с целью постановки их на диспансерный учет и раннего начала профилактических и лечебных мероприятий.

Технический результат изобретения – выделение на основании данных генетической диагностики четырех категорий риска развития ИБС, что будет

способствовать повышению эффективности прогнозирования риска развития ИБС, особенно у лиц молодого возраста.

Поставленная задача решается тем, что в способе прогнозирования риска развития ИБС у лиц на основании данных генетической диагностики методом секвенирования следующего поколения (NGS) выявляется факт наличия редких (с частотой минорного аллея в популяции менее 1%) и низкочастотных (с частотой минорного аллея в популяции от 1% до 5%) ВНП. Далее из всех выявленных в результате генетической диагностики редких и низкочастотных ВНП в генах LDLR, APOB, PCSK9, APOC2, APOA5, LPL, ANGPTL3, APOC3 и ANGPTL4 отбирают ВНП, которые удовлетворяют следующим двум общим критериям. Затем на основании отобранных по критериям редких и низкочастотных ВНП в генах LDLR, APOB, PCSK9, APOC2, APOA5, LPL, ANGPTL3, APOC3 и ANGPTL4 осуществляют разделение на две группы: ВНП с повышенным риском ИБС и ВНП со сниженным риском ИБС, и каждый ВНП получает соответствующий риску балл, при этом: к группе редких и низкочастотных ВНП с повышенным риском ИБС относят: все отобранные редкие и низкочастотные ВНП гена LDLR за исключением ВНП rs72658867, и признак оценивают в 4 балла на каждую минорную аллель ВНП гена LDLR; все отобранные редкие и низкочастотные ВНП гена LPL, APOC2 и APOA5, и признак оценивают в 2 балла на каждую минорную аллель ВНП генов LPL, APOC2 и APOA5; редкие и низкочастотные ВНП генов APOB и PCSK9, связанные с развитием семейной гиперхолестеринемии, и признак оценивают в 2 балла на каждую минорную аллель отобранных ВНП генов АРОВ и PCSK9. К группе редких и низкочастотных ВНП со сниженным риском ИБС относят: все отобранные редкие и низкочастотные ВНП генов ANGPTL3 и ANGPTL4, и признак оценивают в (-1) балл на каждую минорную аллель ВНП генов ANGPTL3 и ANGPTL4; редкие и низкочастотные ВНП генов APOB, PCSK9 и APOC3, приводящие к развитию семейной гипобеталипопротеинемии, и признак оценивают в (-1) балл на каждую минорную аллель отобранных ВНП; редкие и низкочастотные ВНП rs11591147 гена PCSK9 и rs72658867 гена LDLR, и признак оценивают в (-0,5) балла на каждую минорную аллель отобранных ВНП. Для учета совместного эффекта нескольких редких и низкочастотных ВНП генов LDLR, APOB, PCSK9, APOC2, APOA5, LPL, ANGPTL3, APOC3, ANGPTL4 у пациента суммируются полученные для каждого аллеля, каждого редкого и низкочастотного ВНП баллы. На основании полученного суммарного балла за редкие и низкочастотные ВНП пациентов делят на 3 основные группы: со значением балла за редкие и низкочастотные ВНП 2 балла и более — с очень высоким генетическим риском развития ИБС; со значением балла за редкие и низкочастотные ВНП (-0,5) балла или менее –с референтным

(минимальным относительным риском развития ИБС в данном исследовании) генетическим риском развития ИБС; со значением балла за редкие и низкочастотные ВНП от 0 до 1,5, для которых дополнительно на основании генетического анализа генотипов 59 частых ВНП рассчитывают значение балла единой шкалы генетического риска для 59 частых ВНП (ШГР59) по формуле. При этом минимальное значение ШГР59 составило (-4,416) балла, максимальное значение ШГР59 (-2,01) балла, а значение для 50 перцентиля ШГР59 (-3,186) балла. После определения ШГР59 за частые ВНП все пациенты со значением балла за редкие и низкочастотные ВНП от 0 до 1,5 делятся дополнительно еще на 2 группы: с высоким генетическим риском развития ИБС, и со значением ШГР59 более (-3,186) балла ((-3,186) — значение для 50 перцентиля ШГР59, экспериментально полученное в группе участников данного исследования); с минимально повышенным генетическим риском развития ИБС, и со значением ШГР59 (-3,186) баллов или менее. На основании полученных результатов делают вывод об очень высоком риске развития ИБС у лиц из группы с очень высоким генетическим риском развития ИБС, высоком риске развития ИБС у лиц из группы с высоким генетическим риском развития ИБС и об относительном низком риске развития ИБС у лиц из групп с минимально повышенным генетическим риском развития ИБС и с референтным генетическим риском развития ИБС. При очень высоком или высоком риске развития ИБС пациента направляют к терапевту или кардиологу для проведения диагностики ИБС, постановки на диспансерный учет и раннего начала профилактических и лечебных мероприятий. При относительном низком риске развития ИБС у пациента, абсолютный риск развития ИБС не равен нулю, и поэтому таким пациентам рекомендуется оценка сердечно-сосудистого риска на основании действующих клинических рекомендаций.